Le Pays Marennes Oléron a été fondé grâce à une volonté politique forte qui s'est exprimée il y a plus de 10 ans, juste après la transformation en 1995 du SIVOM de l’île d'Oléron en Communauté de Communes, puis la transformation en 1996 du SIVOM du canton de Marennes en Communauté de Communes : la mise en place et la reconnaissance du Pays s'est faite quasi simultanément, dès 1996.
Une convention de partenariat entre les deux Communautés de Communes datant de septembre 1997 a désigné la Communauté de Communes de l'Ile d'Oléron comme support juridique, administratif et financier du Pays. Depuis lors, le Pays (le siège) est basé à Saint Pierre d’Oléron, hébergé dans les locaux de la Communauté de Communes pour une partie de ses services, l'autre partie de l'équipe technique se trouvant sur le territoire de la Commune de Bourcefranc-le-Chapus (Communauté de Communes du Bassin de Marennes).
M. BLEMON, Maire de Le Grand Village Plage, Président de la Communauté de Communes de l’Ile d’Oléron, en fut le premier Président administratif, avec à ses côtés un Co-Président M. ROUSSEAU, Maire de Bourcefranc le Chapus, Président de la Communauté de Communes du Bassin de Marennes.
Le Pays Marennes Oléron a donc été reconnu par l'Etat dès le 10 juillet 1996 dans le cadre de la Loi LOADT du 4 février 1995 (Loi Pasqua).
En 2000, afin de se mettre en conformité avec la Loi LOADDT de juin 1999 (Loi Voynet), une démarche participative a été initiée dans le cadre de l'"Expérimentation régionale DRS – Développement Responsable et Solidaire", financée par le Contrat de Plan Etat / Région 2000-2006.
Celle-ci a aboutit à l’élaboration et la rédaction de la Charte de développement durable du Pays Marennes Oléron, puis à son adoption en janvier 2004 par les Communautés de Communes, et la mise en place du Conseil de Développement.
Par Arrêté du Préfet de Région du 2 Août 2004, un avis de conformité du périmètre du Pays Marennes Oléron à la Loi d'Orientation pour l'Aménagement et le Développement Durable du Territoire du 25 juin 1999, modifiée par la Loi Urbanisme et Habitat du 2 juillet 2003 a été rendu.
La Charte de développement durable est ainsi devenue le document de référence, le socle sur lequel les projets de développement et d’aménagement du Pays Marennes Oléron peuvent se fonder pour les 10 à 15 ans à venir.